Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	771572	771645	74	38 [0]	[1] 48	hflD	predicted lysogenization regulator

GTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAG  >  minE/771501‑771571                                                                       | gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGCGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:2858911/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:524642/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:2719562/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:2758251/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:2778703/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:2887778/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:322710/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:357336/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:459206/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:473492/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:261404/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:567800/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:571374/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:597728/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:61139/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:68753/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:798751/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:856559/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:964063/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:2265587/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1228010/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1327155/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:147081/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1544814/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1559252/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1602815/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1635692/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1646953/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1729507/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1788091/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1833160/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1870898/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1952872/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1982326/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:2092557/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:2202067/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAg  >  1:1107552/1‑71 (MQ=255) gTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCAAGAGTGTCGAg  >  1:1160429/1‑71 (MQ=255)                                                                       | GTTTCGGACTGTAAATCGAAGTGTTCGAGCTGGCGTTGCAGGCCGTTGATCCGGTTGCCCAGAGTGTCGAG  >  minE/771501‑771571

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑