Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1061526	1061526	1	39 [0]	[0] 26	ydhD	conserved hypothetical protein

GTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAT  >  minE/1061472‑1061525                                                      | gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:48709/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1001125/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:2460644/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:2635560/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:2645054/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:2699012/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:2855225/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:359660/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:424630/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:459130/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:2460103/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:535095/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:594981/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:641441/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:683433/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:85203/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:915686/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:926509/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:960504/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1746301/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1042275/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1088855/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1178987/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1284161/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1375596/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1426968/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1448368/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1486350/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1546413/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:2392955/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1752274/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1815386/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1862719/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:1955775/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:213223/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:2157180/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:2187577/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGATGATACAt  >  1:400713/1‑54 (MQ=255) gTATTTAGAGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAt  >  1:2865933/1‑54 (MQ=255)                                                      | GTATTTAGCGGCAGTTTCTTTGATCAGCTGCTGCAGTTCGCCACGCTGATACAT  >  minE/1061472‑1061525

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑