Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	48232	48242	11	20 [0]	[0] 16	apaH	diadenosine tetraphosphatase

TATATACCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGC  >  minE/48179‑48231                                                     | tatataCGTTCCTGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:157174/53‑1 (MQ=39) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:2084683/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:966843/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:529868/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:301038/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:2855106/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:2778015/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:2725419/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:2679152/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:2112480/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:1005372/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:1883968/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:1415612/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:1327445/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:1297799/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:129447/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:112827/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:1103512/53‑1 (MQ=255) tatataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:1066152/53‑1 (MQ=255)          tCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGc  <  1:581011/44‑1 (MQ=255)                                                     | TATATACCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGC  >  minE/48179‑48231

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑