Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1133621	1133622	2	12 [0]	[0] 27	ydiY	conserved hypothetical protein

TCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCAA  >  minE/1133578‑1133620                                           | tCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:1122206/43‑1 (MQ=255) tCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:1392297/43‑1 (MQ=255) tCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:1448550/43‑1 (MQ=255) tCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:157954/43‑1 (MQ=255) tCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:2380990/43‑1 (MQ=255) tCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:2523442/43‑1 (MQ=255) tCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:309513/43‑1 (MQ=255) tCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:318134/43‑1 (MQ=255) tCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:41604/43‑1 (MQ=255) tCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:559987/43‑1 (MQ=255) tCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:586326/43‑1 (MQ=255)  cAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCaa  <  1:1538866/42‑1 (MQ=255)                                           | TCAGCCGTAAGTGAGGAGCTTTTCGTATTGCCTGATTGTGCAA  >  minE/1133578‑1133620

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑