Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1153167	1153179	13	27 [0]	[0] 25	spy	envelope stress induced periplasmic protein

CACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAACAT  >  minE/1153097‑1153166                                                                      | cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:2358473/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:969631/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:924068/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:901083/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:76110/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:647834/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:577666/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:276061/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:2703898/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:2507115/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:2485540/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:2482019/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:2439282/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:1016801/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:215765/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:2083477/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:1957057/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:1907650/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:188967/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:182597/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:1724293/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:1625031/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:1467352/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:1379215/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:1196366/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAAcat  >  1:1047551/1‑70 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTAGAAcat  >  1:2673033/1‑70 (MQ=255)                                                                      | CACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTGAACAT  >  minE/1153097‑1153166

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑