Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1172569	1172573	5	23 [0]	[0] 2	ynjI/topB	predicted inner membrane protein/DNA topoisomerase III

TTTCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACATT  >  minE/1172499‑1172568                                                                      | tttCCCAGCCATTAAAAGATTACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTAGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:2436744/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:2275867/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:929142/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:855965/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:779974/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:541906/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:516735/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:267967/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:2602555/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:2557334/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:2495652/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:2452594/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:1047462/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:210134/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:2029579/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:1973367/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:1906729/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:1782955/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:1757351/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:1195335/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:1058504/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACAtt  >  1:1049028/1‑70 (MQ=255) tttCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCAGCACAtt  >  1:219565/1‑70 (MQ=255)                                                                      | TTTCCCAGCCATTAAAAGAATACTTCTCGCTCCCAGGATGGTTTTGTAATAAAACTTTTTTCATCACATT  >  minE/1172499‑1172568

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑