Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	59805	59828	24	26 [0]	[1] 15	hepA	RNA polymerase‑associated helicase protein

CAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCT  >  minE/59734‑59804                                                                       | cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGGCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:134648/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2306872/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:749932/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:535439/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:443941/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:378374/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2878565/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:274912/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2742655/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2683833/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2622005/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2596735/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2462627/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2425140/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:1185390/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2296752/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2243237/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2209858/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2151889/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:2107243/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:207069/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:1882590/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:1810962/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:1368293/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:1349983/1‑71 (MQ=255) cAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCt  >  1:1339866/1‑71 (MQ=255)                                                                       | CAGCTCCTGACGGGCGCTCTGGGCATCTTCGCTGTCGCTGTTTGCTGCCTGCAACAGCGGCTCGATATCCT  >  minE/59734‑59804

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑