Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1274768	1274792	25	14 [0]	[0] 5	yodA	conserved metal‑binding protein

TTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACT  >  minE/1274728‑1274767                                        | tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:11576/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:1377144/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:154537/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:1989285/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:2178059/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:2619851/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:2879934/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:328500/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:357470/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:386048/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:527590/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:613172/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:839596/1‑40 (MQ=255) tttATTGTTA‑‑GCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAtcact  >  1:2065181/1‑38 (MQ=37)                                        | TTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACT  >  minE/1274728‑1274767

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑