Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1352499	1352508	10	24 [0]	[0] 24	thiD	bifunctional hydroxy‑methylpyrimidine kinase and hydroxy‑phosphomethylpyrimidine kinase

TTGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGATTT  >  minE/1352428‑1352498                                                                       | ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1982653/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:955733/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:558319/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:342763/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:2738457/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:2542895/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:2463102/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:2366459/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:2360638/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:229133/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:2024592/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1077197/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1833106/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1765544/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1737806/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1714608/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1644348/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1610690/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1523403/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:137251/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1326133/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1268092/1‑71 (MQ=255) ttGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:1093121/1‑71 (MQ=255)  ttgATCTGATAACTTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGAttt  >  1:250156/3‑70 (MQ=255)                                                                       | TTGGATCTGATAACGTTGCAACCGTTCTGCCACCGCTTCAACAATATCGGTTTCCGCCAGCATACCGATTT  >  minE/1352428‑1352498

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑