Missing coverage evidence...
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GATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAT  >  minE/1363879‑1363949                                                                       | gATGCACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:1434241/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:2428585/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:971395/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:843021/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:612486/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:53813/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:2583758/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:2583463/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:255322/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:2472919/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:2455588/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:1182224/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:2396718/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:2342878/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:1667742/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:1624179/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:1418011/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAt  >  1:1296464/1‑71 (MQ=255) gATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCGCAAt  >  1:1212415/1‑71 (MQ=255)                                                                       | GATGAACAGGCTCCGTGGGTGGTGGCGAAACAGGAAGGCCGCGATGCCGACCTGCAGGCAATTTGCTCAAT  >  minE/1363879‑1363949

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑