Missing coverage evidence...
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TTGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTACC  >  minE/1596051‑1596121                                                                       | ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:2409677/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:877509/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:869703/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:359316/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:302725/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:283400/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:27418/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:2691397/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:2563532/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:2546494/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:1385213/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:2351232/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:2332832/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:2247431/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:2233436/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:2086764/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:1679177/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:1457816/1‑71 (MQ=255) ttGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTAcc  >  1:1433326/1‑71 (MQ=255)                                                                       | TTGCCTTTGTCACCACCGTCAGCTTTATCCGCTGCGCCCCATGCCGCCAGATAGGTATAACGCGCGTTACC  >  minE/1596051‑1596121

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑