Missing coverage evidence...
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CCGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATGCTGCT  >  minE/144349‑144419                                                                       | ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgcttct  <  1:1607435/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:1004111/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:229230/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:2429913/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:2548489/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:2718496/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:2761421/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:2894415/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:2911410/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:2919269/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:438481/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:49441/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:500770/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:622046/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:663249/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:778195/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:912027/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:913897/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:998135/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:1593755/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:1102736/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:1261113/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:1448264/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:1489073/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:1538384/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:1590539/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:227895/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:1618198/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:166582/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:1680120/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:2010476/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:2171848/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:2264517/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGGCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:1852603/71‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGAAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:764314/71‑1 (MQ=255)                       tGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:746496/49‑1 (MQ=255)                            aatGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:2241924/44‑1 (MQ=255)                                  gcgcAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATgctgct  <  1:138051/38‑1 (MQ=255)                                                                       | CCGTGCCAGTTTTTCGTCGGCGTGAATAATGCCGCGCAGCTGGTCAGTAAATTGCGTGACCGGATGCTGCT  >  minE/144349‑144419

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑