Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2238428	2238459	32	32 [0]	[0] 36	zraR	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with ZraS

CAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCTTTTT  >  minE/2238357‑2238427                                                                       | gaGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:2253861/70‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:2811524/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:833097/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:790455/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:778856/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:744163/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:640338/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:625781/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:598801/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:597735/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:463316/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:888984/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:385948/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:2872633/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:2860887/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:1033992/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:2714764/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:2711549/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:2474736/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:2347857/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:2319541/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:2155682/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:1399362/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:1371080/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:1366496/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:1283530/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:1157300/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:1116604/71‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:975336/71‑1 (MQ=255)  aGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:2856798/70‑1 (MQ=255)  aGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:459972/70‑1 (MQ=255)                                    cccGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCttttt  <  1:1035134/36‑1 (MQ=255)                                                                       | CAGCGTGCCGCCGTCCGCCTCAACAAAGCGCCCTTCCCGGCGTTTATCGGCTCCAGTAAACGCCCCTTTTT  >  minE/2238357‑2238427

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑