Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2239113	2239146	34	41 [0]	[0] 3	zraS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with ZraR

AGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACCGGAAGCCAGAGGGTG  >  minE/2239042‑2239112                                                                       | aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACCGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:640795/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGTAAGCCAGAGGGTg  <  1:2274001/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:393413/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:2375254/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:2604117/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:2612580/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:2733426/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:2855655/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:2882114/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:34933/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:389199/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1088937/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:425327/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:592527/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:613029/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:635748/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:757142/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:758932/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:772411/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:828443/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:2305396/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1084110/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1238533/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1291028/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1375211/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1446303/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1467308/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1473806/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1660219/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1719018/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1750838/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1994852/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:2025351/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:2070584/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:2146179/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:236649/71‑1 (MQ=255) aGAATATCGATATTATCGTGCGGCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1736940/71‑1 (MQ=255)  gAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:551914/70‑1 (MQ=255)  gAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:2800012/70‑1 (MQ=255)  gAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:941582/70‑1 (MQ=255)          atatTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACAGGAAGCCAGAGGGTg  <  1:1773292/62‑1 (MQ=255)                                                                       | AGAATATCGATATTATCGTGCGTCATCCTTGTGGGTCCTTACGCGTAATATTGACCGGAAGCCAGAGGGTG  >  minE/2239042‑2239112

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑