Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2401643	2401672	30	7 [0]	[0] 3	xerC	site‑specific tyrosine recombinase

CAGCATATGCGTGGCGAACGAGTGACGTAATTTATGCGGATGAACGTGATTATTCAGCCCTTGTTTTAT  >  minE/2401574‑2401642                                                                     | cAGCATATGCGTGGCGAACGAGTGACGTAATTTATGCGGATGAACGTGATTATTCAGCCCTTGTTTTAt  <  1:145660/69‑1 (MQ=255) cAGCATATGCGTGGCGAACGAGTGACGTAATTTATGCGGATGAACGTGATTATTCAGCCCTTGTTTTAt  <  1:1605707/69‑1 (MQ=255) cAGCATATGCGTGGCGAACGAGTGACGTAATTTATGCGGATGAACGTGATTATTCAGCCCTTGTTTTAt  <  1:2515372/69‑1 (MQ=255) cAGCATATGCGTGGCGAACGAGTGACGTAATTTATGCGGATGAACGTGATTATTCAGCCCTTGTTTTAt  <  1:2517955/69‑1 (MQ=255) cAGCATATGCGTGGCGAACGAGTGACGTAATTTATGCGGATGAACGTGATTATTCAGCCCTTGTTTTAt  <  1:2541792/69‑1 (MQ=255) cAGCATATGCGTGGCGAACGAGTGACGTAATTTATGCGGATGAACGTGATTATTCAGCCCTTGTTTTAt  <  1:2631123/69‑1 (MQ=255)  aGCATATGCGTGGCGAACGAGTGACGTAATTTATGCGGATGAACGTGATTATTCAGCCCTTGTTTTAt  <  1:2740040/68‑1 (MQ=255)                                                                     | CAGCATATGCGTGGCGAACGAGTGACGTAATTTATGCGGATGAACGTGATTATTCAGCCCTTGTTTTAT  >  minE/2401574‑2401642

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑