Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2403635	2403656	22	41 [0]	[0] 17	dapF	diaminopimelate epimerase

GCGGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGC  >  minE/2403564‑2403634                                                                       | gcgTATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2841504/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCATCGTTGCCGc  <  1:2326887/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:524672/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:251357/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2798531/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2845610/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:286557/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:356637/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:492618/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:509096/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2411694/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:585122/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:609088/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:697466/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:709903/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:715832/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:780135/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:888475/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:955641/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:974155/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2282646/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:1693968/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:1740474/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:1747920/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:1832557/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2040669/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:1579046/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2119040/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:1389079/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:1505383/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2283657/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2303292/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2343787/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2360968/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2361438/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2384009/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:1432778/71‑1 (MQ=255) gcgGATATCACGCTTATTGCTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:221400/71‑1 (MQ=255)  cgGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:204163/70‑1 (MQ=255)                        gTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:388533/48‑1 (MQ=255)                            tttCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGc  <  1:2413703/44‑1 (MQ=255)                                                                       | GCGGATATCACGCTTATTGGTCAGTCCTTTCAGACGCACAAAACGGGCAAAGCAGCGCGCACCGTTGCCGC  >  minE/2403564‑2403634

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑