Missing coverage evidence...
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ATCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCT  >  minE/2521004‑2521074                                                                       | atagTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2055311/68‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAACGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:834679/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2674218/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:97052/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:800415/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:721206/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:662817/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:631832/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:566687/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:534194/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:480438/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:415422/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:290924/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2875738/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2862878/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2761470/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:1031059/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2535670/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2367101/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2354539/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:234966/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2303487/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2168217/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2119966/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:1931678/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:176255/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:1354828/71‑1 (MQ=255) aTCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:1209425/71‑1 (MQ=255)                  tcTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:1379025/53‑1 (MQ=255)                                    ctAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:2248028/36‑1 (MQ=255)                                     tAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCt  <  1:896534/35‑1 (MQ=255)                                                                       | ATCGTTTAAAAGAGCTGGCTACCGCAGGTTTTACTCTAACGCAGACGTATACCCGTGCGGTGAAAAATGCT  >  minE/2521004‑2521074

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑