Missing coverage evidence...
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TCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGAAA  >  minE/2528137‑2528206                                                                      | tCGAGCGGTTCACGGGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2718617/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:496795/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2598334/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2715903/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2719247/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2806838/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2909653/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2912774/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:295270/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:46700/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2459654/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:554981/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:580797/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:656243/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:676490/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:731712/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:848684/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:871043/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:997851/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:202676/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:1267734/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:1538189/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:154987/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:1568422/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:162922/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:1672677/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:1802566/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:1891957/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:1929624/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:101698/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2066757/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2170759/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2342734/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2344785/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2380711/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2389584/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2400683/1‑70 (MQ=255) tCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGaaa  >  1:2454622/1‑70 (MQ=255)                                                                      | TCGAGCGGTTCACGCGTCGGGCCGGCGGTAATCATAATGTTCAGATGTTTCAGGTCGTTGACGGGCGAAA  >  minE/2528137‑2528206

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑