Missing coverage evidence...
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CGAAGCGCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCGCTG  >  minE/2636242‑2636312                                                                       | cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTATCCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:175696/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:2332923/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:996341/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:408954/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:370409/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:301603/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:2765929/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:2730591/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:2590792/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:1227742/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:1992381/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:1628507/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:1562019/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:1555910/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:1554494/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:1380278/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:1309974/71‑1 (MQ=255) cgaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:1250607/71‑1 (MQ=255)  gaagcgCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:304258/70‑1 (MQ=255)             ggCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCtctg  <  1:2839833/59‑1 (MQ=255)                   gTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCgctg  <  1:533497/53‑1 (MQ=255)                                                                       | CGAAGCGCATCCGGCACAGTTCAGGAATTAACCGTAATGTCATCATCCCGTCCGGTGTTCCGCTCGCGCTG  >  minE/2636242‑2636312

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑