Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2686316	2686344	29	13 [0]	[0] 20	envZ	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with OmpR

GCGGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGA  >  minE/2686245‑2686315                                                                       | gcgGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:1212940/71‑1 (MQ=255) gcgGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:1258687/71‑1 (MQ=255) gcgGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:1671860/71‑1 (MQ=255) gcgGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:1872434/71‑1 (MQ=255) gcgGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:2462672/71‑1 (MQ=255) gcgGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:2470411/71‑1 (MQ=255) gcgGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:2675216/71‑1 (MQ=255) gcgGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:2724206/71‑1 (MQ=255) gccgTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:2539231/68‑1 (MQ=255)  cgGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:2588911/70‑1 (MQ=255)  cgGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:289371/70‑1 (MQ=255)  cgGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:368644/70‑1 (MQ=255)                       aCGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGa  <  1:1814045/49‑1 (MQ=255)                                                                       | GCGGTGGCGAATATGGTGGTCAACGCCGCCCGTTATGGCAATGGCTGGATCAAAGTCAGCAGCGGAACGGA  >  minE/2686245‑2686315

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑