Missing coverage evidence...
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GGGCGGTACTGGTTGGAACTGGCTGACAACAATTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATGTGT  >  minE/2748812‑2748882                                                                       | gggCGGTACTGGTTGGAACTGGCTGACAACAATTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:1090055/71‑1 (MQ=255) gggCGGTACTGGTTGGAACTGGCTGACAACAATTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:1034811/71‑1 (MQ=255) gggCGGTACTGGTTGGAACTGGCTGACAACAATTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:805310/71‑1 (MQ=255) gggCGGTACTGGTTGGAACTGGCTGACAACAATTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:2109847/71‑1 (MQ=255) gggCGGTACTGGTTGGAACTGGCTGACAACAATTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:2706944/71‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATttgt  <  1:2646415/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:915546/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:517898/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:458382/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:2886600/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:2845767/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:2802791/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:2260542/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:1880221/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:1642451/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:1603175/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:1335786/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:1325673/43‑1 (MQ=255)                             acaaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:1303994/43‑1 (MQ=255)                              caaTTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATgtgt  <  1:2400932/42‑1 (MQ=255)                                                                       | GGGCGGTACTGGTTGGAACTGGCTGACAACAATTTCGCTGTATTTGCAGCCTGGGCAACCGCTTTATGTGT  >  minE/2748812‑2748882

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑