Missing coverage evidence...
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GTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCAA  >  minE/2945550‑2945611                                                              | gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGTAGGTTTTCaa  >  1:2289777/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:2028176/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:816824/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:800584/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:794119/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:780077/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:612086/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:544182/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:435271/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:31258/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:27858/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:2440532/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:2089414/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:103952/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:195769/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:1638482/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:1481518/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:1433400/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:1431480/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:1370610/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:1185569/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:1157937/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:1118215/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:1075962/1‑62 (MQ=255) gTGCAACGCCCGGCCGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa  >  1:1716012/1‑62 (MQ=255)                                                              | GTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCAA  >  minE/2945550‑2945611

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑