Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	247865	247887	23	38 [0]	[0] 24	phoR/brnQ	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB/predicted branched chain amino acid transporter

TGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAC  >  minE/247811‑247864                                                      | tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTATAAc  <  1:711652/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:2658637/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1013427/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1939314/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1996960/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:2071514/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:217443/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:2235396/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:2242263/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:2391807/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:2571058/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1936491/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:2715419/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:2758635/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:483889/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:549288/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:61795/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:734590/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:870823/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1620237/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1048283/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1066668/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1195300/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1224416/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1249768/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1432495/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1486752/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1495067/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1605944/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1799948/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1622941/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1658798/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1679026/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1697519/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1727665/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1743342/54‑1 (MQ=255) tGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:1746343/54‑1 (MQ=255)          ttCGGTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAc  <  1:199258/44‑1 (MQ=255)                                                      | TGATTTCTTATCGCTATATACCTCTGGTTTTTAGATCCCTCCTTGCTTTAAAAC  >  minE/247811‑247864

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑