Missing coverage evidence...
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CTTCATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCT  >  minE/399989‑400059                                                                       | cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:631916/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2803110/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2830006/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:302464/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:351927/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:382380/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:44059/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:450999/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:468213/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:476068/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:626073/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2775441/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:65150/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:670742/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:689929/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:705342/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:72209/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:752168/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:85682/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:864791/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:874149/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2002487/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:1090048/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:1150006/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:1347980/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:1379286/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:1418870/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:1536658/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:1656135/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:169722/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:1858406/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:1973557/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:1084265/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2063883/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2126109/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2314126/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2403418/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2466192/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2493596/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2683581/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:270118/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2774787/1‑71 (MQ=255) cttcATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGAGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCt  >  1:2823552/1‑71 (MQ=255)                                                                       | CTTCATACAGTGTTTCAACCTGCTCGATATGAGTGGCGTTGATAGTGATAGATACCGAGTGGTAGTTGCCT  >  minE/399989‑400059

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑