Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	444380	444463	84	64 [0]	[0] 15	kdpE	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with KdpD

ATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAA  >  minE/444327‑444379                                                     | ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1847560/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2517032/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2680985/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2375452/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2299985/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:563964/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:576202/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:579541/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1776305/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:626217/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:153769/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1129873/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1360606/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1352460/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1149691/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1194094/1‑53 (MQ=255) ataaAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAACGATAGCaaa  >  1:959913/1‑53 (MQ=39)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:545201/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2574546/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2620791/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2669128/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1074194/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2824533/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:324891/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:378384/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:415968/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:470068/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:855186/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:969402/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:929407/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:607544/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:62219/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:979236/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:714321/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:747836/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:764997/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:893814/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2060073/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1141111/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1210370/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1302286/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1307797/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1427937/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1529422/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1541550/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1679952/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1683620/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1751738/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:1849889/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2017710/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2476348/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2116397/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2189994/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2198823/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2232933/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:225490/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2298824/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2360330/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:240517/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2437748/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2461560/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa  >  1:2470859/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGACaa  >  1:653149/1‑36 (MQ=255)                  ttAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGACaa  >  1:2236524/1‑36 (MQ=255)                                                     | ATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAA  >  minE/444327‑444379

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑