Missing coverage evidence...
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AACTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTTGATG  >  minE/457438‑457508                                                                       | aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTATCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:2043201/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCCCATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:369600/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:406321/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1718301/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1082628/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1984974/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:2333428/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:2417013/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:2511003/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1899819/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:520481/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:558587/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:578758/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:620348/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:887436/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:906533/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:964271/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1651976/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1116941/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1170252/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:11959/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:122813/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1306057/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1340660/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1359895/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1376379/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1395605/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1400009/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:150517/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1528729/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1641668/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1650973/71‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:1715411/71‑1 (MQ=255)  aCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:357243/70‑1 (MQ=255)  aCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:2690591/70‑1 (MQ=255)  aCTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:2543034/70‑1 (MQ=255)                            gCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTtgatg  <  1:2700405/44‑1 (MQ=255)                                                                       | AACTGTTATCTCACGGTTTGTTACCGGGCGTGGTGCAGGTGCCACATAACGGGCAGCCGATTGTGTTGATG  >  minE/457438‑457508

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑