Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	866149	866161	13	17 [0]	[0] 32	rluB	23S rRNA pseudouridylate synthase

CACCACCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGC  >  minE/866162‑866232 |                                                                       caccacCGATGGTGAACTGGCAACCCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:2904500/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:2426099/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:918116/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:9158/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:870554/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:833860/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:63555/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:587015/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:540290/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:532403/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:485649/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:2789874/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:2724864/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:2511623/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:2508104/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1070541/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:2187014/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:2185792/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1992241/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1959177/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1908993/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1829534/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1793165/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1675319/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:165290/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1580434/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1477551/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1385500/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:137589/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1268380/1‑71 (MQ=255) caccacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgc  >  1:1185746/1‑71 (MQ=255) cacaacCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCaa                                >  1:453955/1‑41 (MQ=255) |                                                                       CACCACCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGC  >  minE/866162‑866232

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑