Missing coverage evidence...
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CCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTT  >  minE/875575‑875645 |                                                                       ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:2207942/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:692185/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:660277/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:657096/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:656187/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:599720/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:586020/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:339836/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:2898852/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:2862383/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:2836656/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:2751683/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:2738428/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:2712616/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:2610131/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:1044709/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:2049578/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:1934341/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:1877442/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:158717/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:1517194/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:1463300/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:1351144/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:1290852/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:114695/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:1069171/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:1065897/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGGCGAAttt  <  1:1861276/71‑1 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCAAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAAttt  <  1:1423345/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTT  >  minE/875575‑875645

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑