Missing coverage evidence...
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TCATCGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTGGCG  >  minE/1028187‑1028257 |                                                                       tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCa           >  1:504141/1‑62 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:665661/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2432046/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2557135/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:274293/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2811675/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:315849/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:391093/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:522556/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:559621/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:1159582/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:677717/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:724665/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:786676/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:875289/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:885461/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:893719/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:93719/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:954658/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2024026/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:1058377/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:1257214/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:131904/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:1430161/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:1438838/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:1872737/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:1918419/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:194384/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:1969594/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2400334/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2048500/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2198173/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2234394/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2254582/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2285514/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2354430/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2365132/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGCGCCAGTGGTggcg  >  1:2830024/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTCGTGGTGTGCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2523718/1‑71 (MQ=255) tcatcGACTTAGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTATGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:2550118/1‑71 (MQ=255) tcataGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTggcg  >  1:640234/1‑71 (MQ=255) |                                                                       TCATCGACTTCGTGGTGTTCGGTATTTTGCATGGTCTGTCAACCAAGTGGTACATGGTGCCAGTGGTGGCG  >  minE/1028187‑1028257

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑