Missing coverage evidence...
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TCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAA  >  minE/1057295‑1057363 |                                                                     tCGAAACGGTTATTATTGATGAAGTCCTCGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1759554/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGGATCTGGCGTTaa  <  1:786053/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:2596733/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:2592267/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:2600196/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:2627855/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:2665091/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:2728389/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:277526/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:282236/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:339105/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:340913/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:391707/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:408654/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:57457/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:589361/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:619501/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:633860/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:684400/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:706764/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:731598/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1904013/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1481895/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1552112/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1563175/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1565869/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1581498/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1678620/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1688350/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1766417/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:180405/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1176467/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1912919/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:1914939/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:193747/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:2068770/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:2078679/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:2094840/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:210130/69‑1 (MQ=255) tCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTaa  <  1:2545174/69‑1 (MQ=255) |                                                                     TCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAA  >  minE/1057295‑1057363

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑