Missing coverage evidence...
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GGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAT  >  minE/1071382‑1071452 |                                                                       ggTCGACGTTAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACATGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1764309/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCTCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2166971/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCTTCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1562987/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCATGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2386276/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2383300/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:996313/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2398245/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2430602/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2566084/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2616877/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:277448/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2817096/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2853336/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2859728/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:477948/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:669306/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:675764/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:726926/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:873360/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:884396/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1085625/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2179156/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1302991/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1366147/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1396066/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1396886/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1401186/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1539570/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1635972/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:179859/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1808704/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1834612/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1850166/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1883618/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1964694/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:1987703/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:2065542/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAt  <  1:223169/71‑1 (MQ=255) ggTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGATTCCGTTCTCAt  <  1:1181745/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTTCTCAT  >  minE/1071382‑1071452

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑