Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1177040	1177062	23	22 [0]	[0] 11	sppA	protease IV

TGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAA  >  minE/1177063‑1177111 |                                                 tGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATaa  <  1:1037950/49‑1 (MQ=255) tGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATaa  <  1:1417019/49‑1 (MQ=255) tGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATaa  <  1:141723/49‑1 (MQ=255) tGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATaa  <  1:147593/49‑1 (MQ=255) tGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATaa  <  1:1528038/49‑1 (MQ=255) tGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATaa  <  1:1828478/49‑1 (MQ=255) tGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATaa  <  1:1993258/49‑1 (MQ=255) tGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATaa  <  1:2250515/49‑1 (MQ=255) tGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATaa  <  1:43429/49‑1 (MQ=255) tGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATaa  <  1:586820/49‑1 (MQ=255) tGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATaa  <  1:596889/49‑1 (MQ=255) |                                                 TGCACGGCTTTGCCACCAACGGTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAA  >  minE/1177063‑1177111

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑