Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1207252	1207255	4	5 [0]	[0] 15	manY	mannose‑specific enzyme IIC component of PTS

GCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTC  >  minE/1207256‑1207301 |                                              gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:1440922/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:1457227/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:1666206/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:184179/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:1976851/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:2302425/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:2494439/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:2909421/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:2916320/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:52233/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:563335/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:714503/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:805447/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGCTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:1954926/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCATCAGAGCATTGGTGAAGGTATCGCACTGGCAATCCctc  >  1:256445/1‑46 (MQ=255) |                                              GCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTC  >  minE/1207256‑1207301

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑