Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1440302	1440304	3	6 [0]	[0] 14	ompC/rcsD	outer membrane porin protein C/phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

ATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAT  >  minE/1440305‑1440358 |                                                      attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCtttttt                    >  1:548153/1‑36 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:1071453/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:1681249/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:1762604/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:2235457/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:22931/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:2317510/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:2565564/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:501501/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:523739/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:645193/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:717964/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:878829/1‑54 (MQ=255) attaACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAt  >  1:983611/1‑54 (MQ=255) |                                                      ATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGCCACTGCATACTGAT  >  minE/1440305‑1440358

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑