Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1557776	1557779	4	5 [0]	[0] 15	emrY	predicted multidrug efflux system

GATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTG  >  minE/1557780‑1557850 |                                                                       gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACt   >  1:1870457/1‑70 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACt   >  1:2062335/1‑70 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:1334138/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:1345069/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:1741891/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:2021478/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:2216677/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:2364019/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:2597101/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:342758/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:705645/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:712483/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:897737/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:965111/1‑71 (MQ=255) gATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTg  >  1:969211/1‑71 (MQ=255) |                                                                       GATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTG  >  minE/1557780‑1557850

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑