Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1634450	1634463	14	6 [0]	[0] 44	acrD	aminoglycoside/multidrug efflux system

AAGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAT  >  minE/1634464‑1634503 |                                        aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACATAACGCGCAGAt  >  1:1278771/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGa   >  1:367267/1‑39 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:488366/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2468492/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2577586/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2719483/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2798724/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2852500/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2905535/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2916383/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:298222/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:347106/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:474982/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2386486/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:6094/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:725992/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:770405/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:803336/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:824152/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:907453/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:933142/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:962257/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:995355/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:184724/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1127063/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1257777/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1309357/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1595021/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1611539/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1634310/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1645389/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:171507/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1837429/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1020996/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1864071/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1890057/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1905762/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2082049/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2143384/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:226063/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2262960/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:2363585/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCCATTGAGACACAGAACGCGCAGAt  >  1:2283660/1‑40 (MQ=255) aaGATGTCACTGATGCAATTGAGTCACAGAACGCGCAGAt  >  1:1432168/1‑40 (MQ=255) |                                        AAGATGTCACTGATGCCATTGAGTCACAGAACGCGCAGAT  >  minE/1634464‑1634503

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑