Missing coverage evidence...
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TGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATG  >  minE/1705972‑1706034 |                                                               tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:2347860/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:901086/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:324540/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:2765347/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:2745363/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:2680157/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:2635490/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:2632029/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:2580881/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:2480062/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:1053821/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:2339196/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:2074234/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:2006409/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:1871101/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:1800759/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:1590615/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:1526848/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:1358563/63‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATg  <  1:1058081/63‑1 (MQ=255) |                                                               TGGCGAGGTGCAAGAGTGTGTATTACGTTTAAATCACATTATCTTGCAAAGGGATTGGTTATG  >  minE/1705972‑1706034

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑