Missing coverage evidence...
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CCAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTACC  >  minE/1938432‑1938501 |                                                                      ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTTTTGCCTTTAcc  <  1:1829500/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCGTTTAcc  <  1:6934/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:2425196/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:904928/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:875039/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:771750/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:733550/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:640898/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:599948/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:350271/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:2820840/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:2735444/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:2688533/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:2575433/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:2537038/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:1097518/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:2404302/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:2239188/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:2161059/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:1827868/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:175870/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:1694452/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:1486436/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:141362/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:1399990/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:1376381/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:129328/70‑1 (MQ=255) ccAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTAcc  <  1:1238517/70‑1 (MQ=255) |                                                                      CCAGATAGGTTTCCAGCCAGTAAACCGCCTCTTCACCTAACGGCACCAGACGCTCTTTGTTGCCTTTACC  >  minE/1938432‑1938501

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑