Missing coverage evidence...
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ATCGATCGCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGACAC  >  minE/2036343‑2036413 |                                                                       atcgatcgCTTCGTTGAGCTTCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:459431/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:2241154/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:2219334/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:2401153/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:2468534/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:2521615/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:2531940/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:264845/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:2665/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:2693817/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:344607/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:516571/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:601404/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:645383/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:697128/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:780312/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:82728/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:888150/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:931661/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:981213/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1723256/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1141105/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1178180/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1213557/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:129556/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1321891/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1373767/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1450955/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1546206/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1672488/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1090019/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1778824/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1781791/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1811643/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1838225/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1875418/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:1951189/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:207882/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:2119623/71‑1 (MQ=255) atcgatcgCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGacac  <  1:2175011/71‑1 (MQ=255) |                                                                       ATCGATCGCTTCGTTGAGCTGCGTGAACAGTATGGCTTCCAGTTGCTGCATCTCACCTGCTGTCGCGACAC  >  minE/2036343‑2036413

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑