Missing coverage evidence...
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TTGTTGCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCGG  >  minE/2162138‑2162206 |                                                                     ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAATATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1497883/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:538026/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2158904/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2231134/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2347781/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:238024/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2515105/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2573032/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2702082/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2812935/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2876615/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:345662/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2059960/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:60842/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:682770/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:739676/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:746386/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:781162/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:858582/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:92480/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:933124/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1684824/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1177774/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1194994/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1230580/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1255157/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1416410/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1444066/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1534539/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1573268/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:163109/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2150825/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:170295/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1769934/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1816833/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1868591/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1870700/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:1872819/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2011070/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCgg  <  1:2014466/69‑1 (MQ=255) ttgttgCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACACgg  <  1:1103663/69‑1 (MQ=255) |                                                                     TTGTTGCCCTGCTTTTTCGCCAGATCGATAAGATGGAGCAGCAGTGCCAGTCCCCCCGTATCCACGCGG  >  minE/2162138‑2162206

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑