Missing coverage evidence...
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CGACCCCTTTTTGTGATTTGTGACAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTG  >  minE/2194123‑2194202          |                                                                       cGACCCCTTTTTGTGATTTGTGACAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTg           >  1:137906/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTcgcg                                >  1:1428614/1‑41 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATAGTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:463396/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:557841/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:225143/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2260884/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2517359/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:261515/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2693269/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2718598/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:400582/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:523118/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2232165/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:566020/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:60854/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:608699/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:719855/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:76090/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:821473/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:889543/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:1988687/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:1169960/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:1196402/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:1200472/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:1598778/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:1721379/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:1836987/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:185078/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:1885832/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:1933976/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2241930/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2017129/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2041200/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2114188/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2127902/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2157418/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:1012942/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTAGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:2727118/1‑71 (MQ=255)          tttgtgatttgtgaCAGGTTTTAACCCGCAAAATGCTCGAGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTg  >  1:21421/1‑71 (MQ=255)          |                                                                       CGACCCCTTTTTGTGATTTGTGACAGGTTTTAACCCGCCAAATGCTCGCGCTTCAGATACTCTTCGCTTTGCATCTCTTG  >  minE/2194123‑2194202

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑