Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2260956	2260962	7	3 [0]	[0] 28	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

CTGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAATT  >  minE/2260963‑2261033 |                                                                       ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCt               >  1:2746145/1‑58 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATaa     >  1:2795590/1‑68 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:2644531/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:901243/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:860285/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:704031/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:685382/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:626063/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:601786/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:540153/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:2710597/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:2365673/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:2293045/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:2103967/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:2026714/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:1936518/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:1883727/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:1492183/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:1477127/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:1466828/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAtt  >  1:1176427/1‑71 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAt   >  1:111698/1‑70 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAt   >  1:2755752/1‑70 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAt   >  1:1929745/1‑70 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAt   >  1:1635115/1‑70 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAt   >  1:674925/1‑70 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAt   >  1:828623/1‑70 (MQ=255) ctGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTCCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAAt   >  1:2340711/1‑70 (MQ=255) |                                                                       CTGAATCGGGAATACGGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATAAATT  >  minE/2260963‑2261033

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑