Missing coverage evidence...
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ATGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCT  >  minE/2314292‑2314359 |                                                                    aTGGGGCTGTTCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:1858080/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTTCt  <  1:2267376/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:886255/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:1077085/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:882304/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:825621/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:751262/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:394556/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:326276/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:279392/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:2769896/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:2740379/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:2675372/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:2617877/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:2509536/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:2488023/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:2436575/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:2252010/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:2063568/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:2038437/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:1817534/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:1791477/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:1728191/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:1662232/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:1537048/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:1367011/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:1179710/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:1144225/68‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGAGCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCt  <  1:1293321/68‑1 (MQ=255) |                                                                    ATGGGGCTGATCCTGGCGTTAACGGACGATGGCAACGGTGTACCACGCGGCCCTTTGGCTCCCTTGCT  >  minE/2314292‑2314359

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑