Missing coverage evidence...
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TAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAT  >  minE/2440450‑2440520 |                                                                       tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:419033/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2584464/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2606221/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:267533/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2700885/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2760080/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2816104/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2917716/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:302840/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:313229/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:321048/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2563737/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:439616/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:460815/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:553606/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:622859/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:62814/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:769925/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:818899/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:914466/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:970188/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2016615/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:1144083/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:1267551/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:1279747/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:1454943/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:1459764/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:1555301/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:1787910/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:1827828/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:1129012/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2044387/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2045502/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2147709/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2327232/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2360342/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2429790/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2441258/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2450101/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:2521639/71‑1 (MQ=255) tAGGAGATATCGAGACCAGAAACACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAt  <  1:1402591/71‑1 (MQ=255) |                                                                       TAGGAGATATCGAGACCAGAATCACGCATGTTCAGGCCCTGGTTCAGACCCTGTGCGCCACAGCCGACGAT  >  minE/2440450‑2440520

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑