Missing coverage evidence...
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CCCGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCACC  >  minE/2712994‑2713064 |                                                                       cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCtt                           >  1:2067026/1‑46 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCa    >  1:743219/1‑69 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCa    >  1:181113/1‑69 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:2164791/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:964104/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:963494/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:948673/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:571422/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:2743848/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:2592477/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:257902/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:1076954/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:2077387/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:1916922/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:1682876/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:1677105/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:1424552/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:1267548/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:1168292/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:114151/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAc   >  1:332874/1‑70 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAc   >  1:94262/1‑70 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTAGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:14784/1‑71 (MQ=255) cccGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCCTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCAcc  >  1:37522/1‑71 (MQ=255) |                                                                       CCCGCTTTGGTTTCAGCTTTCAGCGCCGCAACTGTGTGGCAGCCTTTGTTGATGGCAGCAATCAGATCACC  >  minE/2712994‑2713064

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑