Missing coverage evidence...
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GCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAC  >  minE/2960461‑2960531 |                                                                       gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGATATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2394107/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTtaata            >  1:111792/1‑61 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGtata   >  1:886997/1‑70 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:65724/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:279734/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2824461/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2867021/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:382134/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:430604/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:46509/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:57086/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:616354/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:276351/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:683319/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:685722/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:750415/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:830738/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:877800/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:894161/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:916819/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:923787/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:935958/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:1994215/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:1131977/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:1153847/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:1210452/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:1257047/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:149932/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:157830/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:1590498/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:1883723/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:1987662/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2308873/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2028505/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2065858/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2126963/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2173036/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2202035/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2245142/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2290003/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2306588/1‑71 (MQ=255) gCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCAGGGAACCGCCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAc  >  1:2881122/1‑71 (MQ=255) |                                                                       GCCGTGCTTTGCGAGTTGCGCCGGGAACCGGCGGATGAGATTGCGCAAGCGTTGCTTAATAACACGTATAC  >  minE/2960461‑2960531

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑