Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2972801	2972856	56	6 [0]	[0] 28	radA	predicted repair protein

GGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTT  >  minE/2972857‑2972927 |                                                                       ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa               >  1:1086989/1‑58 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTg            >  1:2553464/1‑61 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCgg       >  1:900700/1‑66 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:2473918/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:84357/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:751671/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:557503/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:556553/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:543252/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:441012/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:419655/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:307020/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:2890170/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:2847204/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:2553379/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:1065773/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:2439113/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:2395810/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:2390095/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:2384396/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:2367278/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:2147280/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:2102400/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:1669616/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:1604833/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:1409656/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:1120911/1‑71 (MQ=255) ggCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCtt  >  1:1069063/1‑71 (MQ=255) |                                                                       GGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTT  >  minE/2972857‑2972927

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑