Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2974307	2974342	36	19 [0]	[0] 29	nadR	bifunctional DNA‑binding transcriptional repressor and NMN adenylyltransferase

CTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAA  >  minE/2974343‑2974390 |                                                cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:2398158/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:888039/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:804858/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:745763/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:723090/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:555605/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:496313/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:2879065/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:2844072/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:2762675/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:2742396/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:2734776/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:2718952/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:269310/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:1054395/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:2357170/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:2311759/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:2311386/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:2204300/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:1990615/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:1974429/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:1741726/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:1670168/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:1665635/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:1601245/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:1450266/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:130991/48‑1 (MQ=255) cTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:1133242/48‑1 (MQ=255) cTGGCAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGaa  <  1:877446/48‑1 (MQ=255) |                                                CTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAA  >  minE/2974343‑2974390

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑