Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2979251	2979296	46	37 [0]	[0] 51	trpR	DNA‑binding transcriptional repressor, tryptophan‑binding

CGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGAA  >  minE/2979297‑2979366 |                                                                      cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAgg            >  1:999915/1‑60 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTg    >  1:1423449/1‑68 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2561715/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2558139/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2603565/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2658223/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2664330/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:268247/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:268444/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2699722/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2729724/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2736897/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2759540/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2918800/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:323712/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:351928/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:600488/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:642070/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:719709/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:780301/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:789440/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:793302/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:823910/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:838917/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:934075/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:947425/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1724101/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1157153/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1208041/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1268009/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1290121/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1357126/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1412854/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1464720/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1527946/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1634394/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1640125/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1657099/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1694225/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1025955/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1798882/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1849855/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1876391/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:1907566/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2034296/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2101293/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2310602/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2407626/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2425480/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGaa  >  1:2497818/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGCTGTTGCTGaa  >  1:2867110/1‑70 (MQ=255) |                                                                      CGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGTGTTGCTGAA  >  minE/2979297‑2979366

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑