Missing coverage evidence...
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ACAATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTG  >  minE/239082‑239145 |                                                                acaATCCGCTACCGTGGATGTACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:664181/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTAtt   >  1:552650/1‑63 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:323179/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2394312/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2405334/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2609876/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:261480/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2685246/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2688325/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2698946/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2796167/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2280836/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:352877/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:367484/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:477239/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:488843/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:692006/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:792269/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:1970330/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:115287/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:1404289/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:1439883/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:1580487/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:1645027/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:1697456/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:1861296/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:1877087/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:1145057/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:1987937/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2081811/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2099684/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2151011/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2151022/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2171766/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2194244/1‑64 (MQ=255) acaATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTg  >  1:2277967/1‑64 (MQ=255) |                                                                ACAATCCGCTACCGTGGATGGACGAAGACGAACTGCGTTATCGCGAGGAAGTCCCTTGTTATTG  >  minE/239082‑239145

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑